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文件大小: 144kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-03
详细说明:对准器
跑
生成可执行文件
$ g++-10 main.cpp -o hewill -pthread -ltbb -std=c++20 -O3 biomodern/ssw.cpp -Wno-ignored-attributes
索引(仅支持未压缩的hs37d5.fa, )
$ ./hewill index /mnt/fa/hs37d5.fa
对齐(仅支持未压缩的fastq)
// fa_path fq1_path fq2_path sam_prefix sample_name(SM) read_group(RGID) thread_num
$ ./hewill align /mnt/fa/hs37d5.fa /mnt/fq/HG001.1.fq /mnt/fq/HG001.2.fq /mnt/sam/HG001 HG001 1 80
表现
与 :
重要的
该比对器在以下测序特性上进行了
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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