文件名称:
metaDEGalaxy：包含用于Galaxy实例的metaDEGalaxy脚本和包装-源码
开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-03
详细说明：银河系
MetaDEGalaxy是运行在Galaxy平台上的宏基因组分析工具。 有许多用R和python编写的脚本组成了执行16S rRNA分析的Galaxy工作流程。 greengenes数据库在MetaDEGalaxy中用作参考数据库。
参考
Mike WC Thang， ， ，Dominique Gorse，Matthew A Field，2019年 ：用于16S元基因组数据差异丰度分析的Galaxy工作流程。
工具
-配对末端reAd mergeR
它是USEARCH工具的替代品
脚本依赖项：
Biopython（v 1.74）
python> = 3
Bioconductor-phyloseq（v 1.22.3）
r-base（v 3.4.1）
r-getopt（v 1.20.0）
ghostscript（v 9.18）
bioconductor-deseq2
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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