开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-27
详细说明:该管道可以分析来自全长单细胞RNA测序(scRNA-seq)方法的数据。
介绍
该管道是使用构建的, 是一种工作流工具,可以以非常便携的方式跨多个计算基础架构运行任务。 它带有docker容器,使安装变得简单,结果可高度重现。
快速开始
一世。 安装
ii。 安装或以实现完整的管道重现性(请参阅 )。 请注意,ramdaq不支持conda。
iii。 自动下载管道并使用单个命令在最小数据集上对其进行测试
nextflow run rikenbit/ramdaq -profile test, < docker>
请检查并启用docker或singularity来为您的本地计算环境设置适当的执行设置。
iv。 开始运行您自己的分析!
iv-i。 您可以在不下载参考注释数据的情况下运行ramdaq。
nextflow run rikenbit/ramdaq
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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