文件名称:
chipPCR：辅助功能的工具包，用于预处理扩增数据-源码
开发工具:
文件大小: 2mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-27
详细说明：chipPCR软件包是用于预处理扩增曲线数据的工具包。 扩增数据可以从常规PCRReact或等温扩增React获得。 该软件包包含归一化和基线扩增曲线的功能，检测扩增React开始的程序，用于扩增数据的多个平滑剂，区分正负扩增React的功能以及确定扩增效率的功能。 平滑器基于LOWESS，移动平均值，三次样条，Savitzky-Golay等。
此外，第一近似近似导数最大值（FDM）和第二近似近似导数最大值（SDM）可以通过5点模板作为实时放大曲线的量化点进行计算。 chipPCR包含实验核酸扩增系统的数据集，包括VideoScan HCU和毛细管对流PCR（ccPCR）系统。 扩增数据是通过在各种温度条件下通过解旋酶依赖性扩增（HDA）或聚合酶链React（PCR）生成的。 作为检测系统，使用了嵌入染料（EvaGreen，SYBR Green）和水解探针（TaqMan）。
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chi
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