文件名称:
OpenDBA：GPU加速的动态时间扭曲（DTW）重心平均-源码
开发工具:
文件大小: 11mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-27
详细说明：OpenDBA的
GPU加速的动态时间扭曲（DTW）重心平均
tl; dr该代码使大型时序数据集的平均速度比现有的基于单线程CPU的方法至少快100倍，并且作为奖励可生成距离矩阵，从而有助于扭曲的时间序列聚类分析（例如，纳米Kong直接的白盒分析） RNA测序信号）。
编译中
需要CUDA Toolkit 7或更高版本： :
此代码仅在Linux上经过测试。
make
如果要在Compute Capability小于6.1（〜2016之前制造）的GPU上运行此代码，则需要通过以下方式从openDBA.cu中删除对双精度浮点的支持：
make DOUBLE_UNSUPPORTED=1
快速开始
首先，请确保您的计算机中装有NVIDIA GPU。
如果您有多达数千个文本文件，每行一个数字，请使用以下命令生成（1）序列距离矩阵和（2）共识序列：
openDBA text floa
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
相关说明
- 本站资源为会员上传分享交流与学习,如有侵犯您的权益,请联系我们删除.
- 本站是交换下载平台，提供交流渠道，下载内容来自于网络，除下载问题外，其它问题请自行百度。
- 本站已设置防盗链，请勿用迅雷、QQ旋风等多线程下载软件下载资源，下载后用WinRAR最新版进行解压.
- 如果您发现内容无法下载，请稍后再次尝试；或者到消费记录里找到下载记录反馈给我们.
- 下载后发现下载的内容跟说明不相乎，请到消费记录里找到下载记录反馈给我们，经确认后退回积分.
- 如下载前有疑问，可以通过点击"提供者"的名字，查看对方的联系方式，联系对方咨询.
