文件名称:
VPTMdb：病毒翻译后修饰位点的网络服务器-源码
开发工具:
文件大小: 8kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-26
详细说明：VPTM数据库
VPTMdb是病毒翻译后修饰位点（PTM）的综合数据库。 我们已经收集了1240个PTM站点，这些站点将818个实验确认的PTM站点整合到从150种出版物中手动提取的43种病毒中，以及从UniProtKB / Swiss-Prot中提取的422种PTM中。 VPTMpre是一种新颖的基于特征的预测器，已集成到VPTMdb中，供用户预测感兴趣的磷酸化位点。
作者摘要
翻译后修饰（PTM）在病毒蛋白的调控中起着重要作用。 但是，由于数据集的限制，没有对病毒蛋白PTMs特性进行详细研究。 在此手稿中，我们收集了经过实验验证的病毒蛋白翻译后修饰位点，并从生物信息学的角度分析了病毒PTM数据。 此外，我们构建了一个新颖的基于特征的机器学习模型来预测磷酸化位点。 这是使用计算方法探索病毒蛋白修饰在病毒感染中的作用的第一项研究。 有价值的病毒蛋白PTM数据资源将提供有关病毒-宿主相互作用
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