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下载次数: 0
上传时间: 2021-02-26
详细说明：写次数
版本0.1.0
Python脚本，用于从多个计数文件中编写单个基因计数表。 回购包括压缩的示例数据和参考文件。
概述
输入：
每个样本一个.hdf5文件（可以是多个样本，通过对LIMSID进行排序或其他选择的变量进行分组）。
文件名必须包含标识符的唯一组合，这些标识符也可以在元数据文件中作为列名找到。 hdf5文件包含每个基因ID的计数向量（按字典顺序对基因ID进行排序）。
输出：
每组一张表（基因x样本）。
需要元数据：
每组一张表（样本x变量）。
元数据表必须包含名称与文件名相对应的列（因为将基于元数据注释加载文件）。
需要参考基因组文件来提取基因ID：
Homo_sapiens.GRCh37.dna.gencode.v26lift37.basic.with_ERCC.gff
该文件太大，无法在GitHub上进行托管而不进行压缩，因此请确保在克隆存储库后取
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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