文件名称:
BiologicalDataDS2020：生物数据课程资料库，帕多瓦大学数据科学硕士学位-源码
开发工具:
文件大小: 65mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-26
详细说明：生物数据DS2020
生物数据课程项目的存储库，帕多瓦大学数据科学硕士学位。
要求
可以安装所有必需的Python软件包来执行代码
pip install -r requirements.txt
在项目文件夹中时。
其余所有操作都是使用Linux x64计算机执行的，启动了data文件夹中的bash文件。
由于它们的大小，执行代码所需的所有数据库均未包含在存储库中，而是托管在此。 下载它们后，将它们放在data/part_2/original_datasets folder 。
由于所有模型的所有指标的计算都非常耗时，因此我们只是第一次进行计算，将所有结果保存在.csv文件中，然后在Notebook中读取它们。 要从头开始重新计算所有指标以测试所有计算，只需删除data/part_1/HMMs和data/part_1/PSSMs data/part_1/HMMs中已parsed子文
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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