文件名称:
RELICS:CRISPR筛选中的调控元件位置识别-源码
开发工具:
文件大小: 559kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-26
详细说明:遗物 :sparkles: :CRISPR筛选中的调控元件位置识别
RELICS是一种用于从平铺CRISPR筛选中发现功能序列的分析方法。 RELICS的当前版本(v.2.0)使用贝叶斯层次模型,并考虑了多个指南的重叠影响,可以共同分析每个重复的多个池,并估计数据支持的功能序列的数量。
简要地; RELICS将关注区域划分为多个部分。 然后,它一次考虑一次放置一个功能序列,同时考虑所有先前放置的功能序列。 RELICS是一种半监督方法,采用一组阳性对照sgRNA作为输入。 请注意,RELICS当前不使用非靶向sgRNA,一次只能分析一个染色体。 我们正在开发多个扩展程序,如果您有任何要求,请随时与我们联系!
这项工作正在不断完善。 请问问题或。
安装
RELICS需要R版本3.5.1或更高版本
获取源代码
使用以下命令将源代码克隆到所需位置: git clone https://github.com/p
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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