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文件大小: 385kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-26
详细说明：FM_Intern_Wrap
语言和包装
所需软件
Trimmomatic-
软件安装
管道脚本布局
hyb_wrap.py
这是包装脚本，旨在接受用户输入并指导管道使用氨基酸靶标或核苷酸靶标。
脚本输入：
--target_enrichment_data如果目标富集测序方法
--whole_genome_data如果数据是整个基因组输入数据
--assembly_data如果数据是SPAdes程序集还是非SPAdes程序集
getNameList.py
getNameList.py将样本名称列表写入文本文件namelist.txt。 然后，该文本文件将用于氨基酸和核苷酸HybPiper脚本中。
参考
约翰逊（MG），加德纳（Gardner），新兴市场（EM），刘洋（Y.），麦地那（R.），戈菲内特（G. HybPiper：使用目标富集从高通量测序读物中提取系统发生学的编码序列和内
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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