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文件名称: Spark技术在基因序列分析中的应用
  所属分类: 其它
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  文件大小: 747kb
  下载次数: 0
  上传时间: 2021-02-25
  提 供 者: weixin_********
 详细说明:生命科学方兴未艾,从食品工业中的细菌培养鉴定到癌症快速诊断,基于DNA分析的应用不断出现,但同时基因分析应用也面临着很大挑战;许多新技术、新方法被应用到基因序列分析应用中,包括Spark、FPGA以及GPU协处理器加速等,这些技术的应用不仅能够使大部分生命科学领域的应用,包括开源和ISV软件,在不需要复杂的MPI编程情况下实现并行化处理,同时Spark内存内计算技术也能够提高分析效率,加速工作流程,缩短分析时间,从而有更多新的发现。本文将介绍如何利用Spark技术运行常用的基因序列分析应用,包括在Spark不同模式下的运行方法,运行过程以及运行结果分析,并比较在不同运算平台以及不同运行参数情况
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