文件名称:
project-1-tinman：由GitHub Classroom创建的project-1-tinman-源码
开发工具:
文件大小: 904kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-24
详细说明：项目描述
关于此存储库的用途及其包含的内容的简要说明
贡献者
特蕾莎·赖斯
Maha
Shrivastava-arushi08bu.edu
储存库内容
提供此仓库中每个脚本/代码文件的简要说明，其作用以及如何执行
r_commands.R
R脚本读取原始的Affymetrix UI33 Plus 2.0芯片数据，一起对数组数据进行归一化，执行RLE和NUSE，作为所有质量控制措施，均使用R封装affy的功能。 这些QC测试的图可以从RStudio导出。 使用ComBat校正的批处理效果并导出为csv。 使用prcomp（）执行主成分分析，结果数据用于绘制PC1对PC2。 为了确保所有Bioconductor软件包都能一起使用，使用了BiocManager。 其他必需的软件包包括：“ affy”，“ affyPLM”，“ sva”，“ AnnotationDbi”，“ hgu13
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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