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使用多样性增量结合二次判别分析预测核小体DNA的形成潜力和核小体的定位
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文件大小: 538kb
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上传时间: 2021-02-24
详细说明：在这项工作中，基于基因组核苷酸的k-mer频率，开发了一种基于多样性增加与二次判别分析（IDQD）相结合的区分核小体DNA和接头DNA的新方法。 当用于预测形成核小体的DNA潜力时，该模型对于酿酒酵母，智人和果蝇果蝇的准确度分别达到94.94％，77.60％和86.81％。 对于酿酒酵母，我们的分类器的接收器操作员特征曲线下的面积为0.982。 我们的结果表明，DNA序列偏好对于核小体形成潜力至关重要，并且在整个真核生物中都可能保守。 该模型成功鉴定出酿酒酵母基因组中富集了核小体或核小体的区域，表明核小体的位置取决于DNA序列的偏好。 因此，IDQD分类器可用于预测核小体定位。
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