文件名称:
使用域间相互作用网络对蛋白质结构域和复杂疾病之间的关联进行优先排序
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文件大小: 401kb
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上传时间: 2021-02-24
详细说明：找到人类复杂疾病的基础遗传变异并找到导致这些疾病的基因至关重要。 由于蛋白质通常由几个结构域组成，因此可以合理地假设有害的遗传变异可能会改变蛋白质域的结构，影响蛋白质的功能并最终导致疾病。 基于这种理解，作者探索了恢复蛋白质结构域与复杂疾病之间关联的可能性。 作者根据非同义单核苷酸多态性（nsSNPs）与复杂疾病之间的关联，疾病之间的相似性以及蛋白质与领域之间的关系来定义蛋白质域与疾病家族之间的关联。 基于域域交互网络，作者提出了一种“按罪恶感”原则，根据候选域与域域交互网络中与一组种子域的平均距离对候选域进行排名。 作者通过在模拟连锁间隔，随机对照和整个基因组上的大规模交叉验证实验来验证该方法。 结果表明，接收器工作特征曲线（AUC分数）下的面积可以高达77.90％，平均等级比率可以低至21.82％。 作者进一步提供了可自由访问的Web界面，用于域和疾病家族之间关联的全基因组格局。
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