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上传时间: 2021-02-23
详细说明：大量研究表明，挖掘基因表达数据对于生物信息学研究和生物医学应用都是重要的。 但是，大多数现有研究仅关注共同调控的基因簇或新兴模式。 实际上，另一种分析方案，即同时挖掘表型和诊断基因，在生物学上也很重要，到目前为止，这种方案很少受到关注。 在本文中，我们探索了局部保守基因簇（LC-Cluster）的新概念来解决这个问题。 具体来说，LC-Cluster包含一个基因子集和一个条件子集，以使这些基因仅在条件子集上显示稳定的表达值（而不是先前工作中同步定义的一致模式的上升和下降），而并非全部给定条件。 为了避免子空间搜索中的指数增长，我们进一步提出了两种有效的算法，即FALCONER和E-FALCON
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