文件名称:
minimax_CNV：使用Minimax方法进行罕见的CNV关联分析（正在进行中）-源码
开发工具:
文件大小: 536kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-23
详细说明：Minimax方法用于稀有拷贝数变异的基因集富集分析
这是使用MORST方法执行稀有拷贝数变异分析的基因集富集分析的代码库。
要设置环境，可以使用setup_conda_env.sh ，它可以在任何Linux系统和Window的WSL中运行。
数据模拟
使用来自的GItest_demo.r运行用于基因集富集分析的模拟数据。
此数据集的CCRET结果是CCRET p-value of GI effect adjusting for length and dosage = 0 6.109567e-09 。
数据位于data/文件夹中：
mycnv2_ds.txt包含基因剂量矩阵（具有条目0、1、2、3、4）。
mycnv2_gi.txt包含基因重叠矩阵（0,1,2）
mycnv2_ln.txt包含事件长度矩阵。
mycnv2_yy.txt包含表型（二进制0,1）。
在与MO
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