文件名称:
ExTraMapper：ExTraMapper是一种使用序列保守性在两个生物之间查找给定直系同源基因对的外显子和转录本水平定位的工具-源码
开发工具:
文件大小: 669kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-23
详细说明：ExTraMapper
ExTraMapper是一种使用序列保守性在两个生物之间查找给定直系同源基因对的外显子和转录本水平映射的工具。 下图显示了ExTraMapper的总体示意图，该图描绘了人类和小鼠基因组之间的同源转录本和外显子对。
运行ExtraMapper
首先阅读所有配置参数
源config.conf
出口EXTRAMAPPER_DIR = $ EXTRAMAPPERDIR
设置提升最小匹配阈值
MAPPED_EXON_THRES = 1.0
输入基因对示例（BRAF）
genePairId =“ ENSG00000157764-ENSMUSG00000002413”
运行Ex
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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