文件名称:
bioeng-project:用于乳腺癌诊断的DL模型-源码
开发工具:
文件大小: 415mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-23
详细说明:生物工程项目/论文
基因表达
包含乳腺癌患者基因表达的数据称为brca_counts.rds ,由于python无法使用.rds文件,因此需要将其转换为.csv 。
brca <- readRDS( ' brca_counts.rds ' )
write.csv( brca , ' brca.csv ' )
Node2Vec
使用的功能网络来自
Wu,G.,Feng,X.&Stein,L.人类功能蛋白相互作用网络及其在癌症数据分析中的应用。 Genome Biol 11,R53(2010)。
Node2Vec仅允许整数作为节点,并且上面的网络文件的节点是UniProt登录号,因此必须进行转换:
library( tidygraph )
library( dplyr )
network_table <- read.table( ' FIs_043009.txt ' , header
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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