文件名称:
WSI2DICOM:将整个幻灯片图像(WSI)转换为多帧DICOM图像-源码
开发工具:
文件大小: 3mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-22
详细说明:此仓库显示了如何将整个幻灯片图像转换为多帧DICOM图像。 这取决于和
动机
在整个机构中标准化WSI格式和传输。
启用更多封装选项以进行海量数据存储
潜在地简化补丁/框架级别的可访问性
这是一个示例,显示可以在DICOM查看器查看转换后的DICOM。
依赖项安装
pip install pydicom openslide_python
您可能还需要python界面以外的。
快速开始
代码超级好用。 测试数据可以从下载。
wsi_fn = '/path/to/your/WSI/example/CMU-1-JP2K-33005.svs'
wsi_dicom_dir = "/path/to/your/output/example/CMU-1-JP2K-33005"
# # convert without compression
# p = parameters(JPEG_COMPRESS=
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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