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文件大小: 29mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-22
详细说明：突变分类
该存储库包含脚本，这些脚本用于生成样本并执行统计方法中报告的分析，该方法使用Zhu，Ong和Huttley的机器学习技术对ENU诱导的小鼠自发性种系突变进行突变分类。
最初设定
ENU_project.yml文件有助于建立一个名为mclass的虚拟环境，并在该虚拟环境中安装所有必需的依赖项。 运行以下命令以使用mclass创建mclass环境（请确保已安装最新版本的conda）。
$ conda env create -f ENU_project.yml
通过运行以下命令激活mclass环境：
$ source activate mclass
该环境已安装了所有必需的依赖项，以运行此存储库中的所有脚本。
回购内容
该存储库包含用于运行两个完全独立的分析的脚本。
loglin目录包含用于运行对数线性分析的脚本和数据。 对数线性分析比较了ENU诱导的小鼠突变和自发突变在小鼠
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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