文件名称:
FIV_FeLV_Transmission-源码
开发工具:
文件大小: 64kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-22
详细说明：FIV_FeLV_Transmission
该存储库的特征和手稿中使用的代码和数据“一个人的传播会预测另一个人：致命病毒的传播动力学的无源代理”
分析管道遵循以下步骤：
FIV基因组的Phyloscanner分析
FIV传输网络的指数随机图模型（ERGM）分析
基于FIV模型和3种替代模型的FeLV传输仿真
仿真结果分析
1. FIV基因组的Phyloscanner分析
FIV基因组可在GenBank中获得。 参见
Phyloscanner分析参数在“ Phyloscanner_networks / Phyloscanner运行参数.csv”中提供
2.指数随机图建模
指数随机图建模的脚本和关联数据遵循以下管道步骤（可以在“ R Scripts”文件夹中找到脚本）：
Phyloscanner_to_network.R：将Phyloscanner输出转换为网络对象。 用途： “ P
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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