文件名称:
fedup:用户定义途径的富集和耗尽的费舍尔测试-源码
开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-21
详细说明:˚Fisher的试验üSER-规定的P值athways电子nrichment和d epletion
fedup是一个R包,它使用Fisher精确测试来测试用户定义路径的富集和耗尽。 该方法设计用于多种途径注释格式(例如gmt,txt,xlsx),以允许用户对自定义注释进行途径分析。 该软件包还与Cytoscape集成在一起,以提供基于网络的途径可视化,从而增强了结果的可解释性。
内容
入门
系统先决条件
R版本≥4.1 R包:
CRAN :openxlsx,tibble,dplyr,data.table,ggplot2,ggthemes,forcats,RColorBrewer
Bioc
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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