文件名称:
pmbcl_exomes：用于分析PMBCL外显子组数据集的脚本-源码
开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-20
详细说明：原发性纵隔B细胞淋巴瘤（PMBCL）外显子组
学习规划
95个肿瘤样本
21个匹配法线
对所有样品进行整体外显子组测序（平均115倍）
变体调用
使用配对分析分析具有匹配正常值的肿瘤样品。 对于未配对的样本，将肿瘤与合并的正常个体（21个正常个体中的10个降低采样并合并）匹配。 下列调用者用于确定体细胞核苷酸变异体和插入缺失：
VarScan
多功能
斯特雷卡
MutSig识别明显突变的基因
复印号码检测
CNVkit
GISTIC识别重要的重复和缺失
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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