文件名称:
pybustools：Python函数读取kallisto-bustools格式-源码
开发工具:
文件大小: 189kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-20
详细说明：pybustools
这是通常使用生成的单细胞RNAseq的的python接口。
安装
请注意所需的gmpy2库，它本身依赖于某些c库。 这些可以通过apt-get install libgmp3-dev libgmp-dev libmpfr-dev libmpc-dev安装在ubuntu上。
git clone https://github.com/redst4r/pybustools
pip install -e pybustools
用法
from pybustools . pybustools import Bus
B = Bus ( folder = '/path/to/bus/output' , bus_name = 'sorted.bus' )
# iterate the records one by one; it yields namedtuples
for reco
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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