文件名称:
strview：一个细工具，用于详细说明STR区域周围的读数和参考之间的对齐方式-源码
开发工具:
文件大小: 4kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-19
详细说明：视线
一个详细说明STR区域周围阅读和参考之间对齐的小工具
用法：strview.py [-h] [--bam BAM] [--read READ] --ref REF --config CONFIG --output OUTPUT [--parasail PARASAIL] [--pysam PYSAM] [--verbose VERBOSE ]
可选参数：-h，--help显示此帮助消息并退出--bam BAM bam文件--read读取读取的文件--ref REF ref文件--config配置配置文件--output输出配置文件--parasail PARASAIL使用parasail获得路线。 必须与详细标志--pysam PYSAM一起使用。从BAM文件中获取对齐方式。 必须与详细标志一起使用--verbose VERBOSE显示不同区域的对齐方式
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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