文件名称:
reCOGnizer：使用COG数据库进行基于域注释的工具-源码
开发工具:
文件大小: 201kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-19
详细说明：识别器
使用数据库进行基于域注释的工具。
特征
reCOGnizer是使用RPS-BLAST和CDD数据库作为参考的蛋白质功能识别的用户友好实现。
它构建了数据库的分离版本，使RPS-BLAST可以在多线程中运行该数据库，从而大大提高了蛋白质注释中最耗时的步骤的速度。
将域分配给蛋白质后，reCOGnizer将CDD ID转换为相应DB的ID，并进一步获得CDD上可用的域描述
根据所涉及的数据库检索更多信息： 然后将这些COG整理到蛋白质与COG的关系表中，其中包括来自COG的三个功能分类。
reCOGnizer还将分配的COG功能转换为EC号，从而提供更多功能信息。
安装
要安装reCOGnizer，只需克隆此存储库并运行install.bash！
git clone https://github.com/iquasere/reCOGnizer.git
sudo reCOGniz
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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