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文件名称: dr_sasa_n:生物分子的溶剂可及表面计算软件-源码
  所属分类: 其它
  开发工具:
  文件大小: 5mb
  下载次数: 0
  上传时间: 2021-02-18
  提 供 者: weixin_********
 详细说明:dr-sasa-生物分子的溶剂可及表面积计算软件 dr-sasa是用于生物分子的溶剂可访问表面积计算软件,支持蛋白质,DNA,RNA和配体输入。 输入文件可以是PDB或MOL2格式。 PDB格式文件将使用NACCESS兼容的VdW半径查找表,而MOL2格式将使用Chimera中使用的相同VdW半径。 如果您在研究中使用此软件,请引用以下内容进行确认: Ribeiro,J.,Ríos-Vera,C.,Melo,F.和Schüller,A.(2018)“计算原子之间的精确接触表面积,以定量分析未键合的分子相互作用”。 生物信息学(已提交)。 操作模式 有五种操作模式。 第一种方法进行通用ASA(可访问表面积)计算,第二种方法计算各种链或分子对象之间的BSA(埋入表面积),第三和第四种方法计算残基和原子之间的CSA(接触表面积),就好像它们是独立的对象一样。 第五个模式不使用SASA或BSA
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