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文件大小: 948kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-18
详细说明：分析POP-seq数据的管道（从比对到峰调用）
图1： K562细胞中POP-seq方案的完整工作流程和数据分析（A）使用trizol裂解细胞以产生三个相（水相，相间和有机相）。 使用RNase A / T1混合物，蛋白酶K和DNase消化来自POP-seq变体的细胞裂解液，然后进行r-RNA消耗，RNA质量检查和文库制备以进行照明测序（B）POP-seq数据处理和下游分析的工作流程。
先决条件
根据用户手册安装以下软件：
fastqc（ ）
Samtools（ ）
Bedtools（ ）
Hisat（ ）
食人鱼（ ）（来自史密斯实验室）
数据集公共访问：
UCSC-
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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