文件名称:
djvdj：一个R包，用于分析AVID-seq数据-源码
开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-18
详细说明：v
djvdj软件包提供了一系列工具来分析和处理单细胞V（D）J测序数据。 这些工具非常简单，可以轻松集成到标准的工作流程中。
安装
您可以使用以下命令从安装djvdj的开发版本：
# install.packages("devtools")
devtools :: install_github( " rnabioco/djvdj " )
进口
使用djvdj，您可以从导入V（D）J测序结果，并使用import_vdj()将这些数据添加到当前的对象中。 提供了一些附加功能，以基于一系列V（D）J度量（包括链，克隆型和CDR3序列filter_vdj()来过滤（ filter_vdj() ）和操纵（ mutate_vdj() ）Seurat对象。
# Import VDJ data
paths <- c(
KI_DN3_GE = " data/tcr/KI_DN3_TCR " ,
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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