文件名称:
Unified_genealogy_paper：现代与古代人类的统一家谱-源码
开发工具:
文件大小: 283kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-17
详细说明：代码“现代和古代基因组的统一家谱”
此回购包含“现代和古代基因组的统一家谱”中使用的代码。 这包括：
基于模拟的和验证
管道以从多个数据集中生成统一的日期树序列
使用古代基因组对树序进行实证验证
代码以产生论文中的所有非示意图人物，以及交互式人物和补充视频
这些分析如下放置在子目录中：
all-data包含用于下载和准备实际数据的所有代码，以及用于创建树序列的管道
src包含用于对真实和模拟数据进行分析和验证的脚本
data包含某些分析所需的参考数据，并且是在其中存储对真实推断的树序列执行的分析结果的位置。 在这里也可以进行评估tsinfer中失配参数的仿真。
simulated-data包含所有基于模拟的分析结果
tools包含用于比较tsinfer和tsdate准确性的方法以及用于处理变体数据文件的工具
您必须首先克隆此存储库，包括以下子模块：
git clone --r
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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