文件名称:
基因路径：确定装配体中的基因顺序和方向-源码
开发工具:
文件大小: 322kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-17
详细说明：基因途径
确定装配体中的基因顺序和方向。
要求
C ++编译器
BLAST +套件（ blastn ， makeblastdb ）
安装
cd src && make && make test
用法
gene-paths --help
gene-paths -g examples/assembly.gfa -f examples assembly.fna -q examples/query1.gfa
背景
动机
开发这些工具是为了帮助回答以下问题：“基因相对于哪里？” 例如，在键入金黄色葡萄球菌SCCmec盒时，IS431是在mecA基因的上游还是下游以及是否反向是很重要的。
如果特征在基
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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