文件名称:
PCRPpipeline:用于处理PCRP数据集的生物信息学管道-源码
开发工具:
文件大小: 21mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-17
详细说明:PCRP管道
用于处理PCRP数据集的生物信息管道
管道要求
python 2.7.14
python-matplotlib
Java 8或更高版本
perl v5.10.1或更高版本
bedtools v2.27.1或更高版本
samtools 1.7
MEME v5 +
ChExMix v0.45在这里可用: :
编译的JAR应该移到此处:/ QC-pipeline / external_app /
运行管道的命令:
sh 11_RUN_MEP_QC_XO.sh -s sampleID.txt -a /path/to/QC-pipeline
sampleID.txt文件格式
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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