文件名称:
MultiModalMuSig.jl:一个Julia包,用于使用主题模型提取突变特征-源码
开发工具:
文件大小: 100kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-16
详细说明:多重模态
一个Julia包,实现了几个用于突变签名估计的主题模型。
多模式相关主题模型(MMCTM)采用矩阵矩阵的数组,其中每个矩阵的第一列是突变类型索引,第二列是特定样本的突变计数。
以下示例说明如何使用MMCTM对SNV和SV计数执行推理:
using MultiModalMuSig
using CSV
using DataFrames
using VegaLite
using Random
Random . seed! ( 42 )
snv_counts = CSV . read ( " data/brca-eu_snv_counts.tsv " , delim = ' \t '
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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