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文件大小: 12mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-16
详细说明：藻类勘探项目
我的藻类基因勘探项目。
当前协议
从预取中下载SRA
使用vdb-validate检查MD5
使用fastq-dump转换为FASTQ
下载一些基因组和注释
地图读取到基因组和注释
从头汇编（Trinity，如果不可映射）
TransDecoder获得肽
蛋酒映射器注释
鲑鱼定量
DESeq2 Wald测试（RScript）
单端分支
多样化，快速注释
关于元数据文件
必须有4列：
所有文件均带有Bioproject ID的“ Bioproject”列
“运行”列-SRR运行-每个文件一个ID
“版式”列-已配对或单个
以“ C_”开头的任意数量的处理列
以“ TC_”开头的任意数量的依从治疗
标头或数据中不允许有空格或破折号；
发布
0.1：从读取到汇编
0.2 ：（当前）带DESeq2的微分表达式（Wald / LRT测试）
0.3：（wip）多个注释源。
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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