文件名称:
facets：在Costello实验室外显子组数据上运行FACETS（https：github.commskccfacets）的脚本-源码
开发工具:
文件大小: 4kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-15
详细说明：面包装
在Costello实验室外显子组数据上运行FACETS（ ）的脚本
制作运行配置文件：在最新版本的配置文件上运行create_input_snp_pileup.py，然后将其子集化，以仅包含您关心的患者。
运行：要同时执行所需的上游分析和FACETS本身运行，请运行命令“ qsub -l vmem = 20gb run_snp-pileup.sh”，该命令将使用snp_pileup_input.txt（您在其中创建的配置文件）中指定的bam文件。步骤1），对它们进行堆积，然后对每个肿瘤：正常组合进行FACETS。
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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