文件名称:
haptreex:单倍型移相器,用于下一代测序数据-源码
开发工具:
文件大小: 42kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-15
详细说明:堆树X
HapTree-X是一种计算工具,可以分阶段各种下一代测序数据。 目前,它支持全基因组,全外显子组,10X基因组学和RNA序列数据。 它对RNA-seq数据特别有用,因为它可以利用等位基因失衡来获得更好的相位基因区域。
安装
HapTree-X二进制文件在下可用于Linux和macOS。
建筑
要从头开始构建HapTree-X,您将需要最新版本的和 (通常随LLVM一起提供)。
然后,发出make生成HapTree-X。 生成的二进制文件将位于build/haptreex 。
用法
基本用法是:
haptreex -v [VCF file with variants to be
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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