文件名称:
GenomicSQLite:SQLite的基因组扩展-源码
开发工具:
文件大小: 129mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-15
详细说明:SQLite的基因组扩展
(“ GenomicSQLite”)
这个为嵌入式RDBMS添加了功能,从而支持基因组生物信息学中的应用程序:
重叠查询和连接的基因组范围索引
in-SQL实用程序功能,例如反向互补DNA,解析“ chr1:2,345-6,789”
自动流存储压缩(也可)
直接从HTTP(S)URL读取(也可)
预先调整的“大数据”设置
2020年10月的这张海报讨论了背景和长期雄心壮志:
我们的演示了Python(几种语言绑定之一)的关键功能。
自行承担风险:该扩展对数据库存储层进行了根本性的更改。 虽然旨在维护ACID交易安全性,但它还很年轻,并且几乎没有零错误。 该项目与SQLite开发人员无关。
从这里开始 :backhand_index_pointing_right:
我们提供为Linux x86-64和macOS Catalina的扩展。 如文档中所指定,还需要SQLite本身的最新版本。
编程语言支持:
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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