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下载次数: 0
上传时间: 2021-02-15
详细说明:具有读深度的主成分分析(RdPCA),用于scRNA-seq数据
具有读取深度的主成分分析(RdPCA)是主成分分析(RdPCA)的扩展,可从读取深度提取生物信号以改善scRNA-seq数据分析中的降维效果。
基本用法
fit_pca_linear在功能model.py返回RdPCA坐标。
fit_pca_linear(expr_mat,
ndim_lat,
cc_mat=None,
size_factor=None,
batch_mat=None,
\tmodel='poisson',
device=torch.device('cpu')
)
expr_mat
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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