文件名称:
genozip:用于基因组文件(FASTQ,SAMBAM,VCF,FASTA,GVF,23andMe ...)的压缩器,比gzip压缩多达5倍,并且速度也更快-源码
开发工具:
文件大小: 3mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-15
详细说明:Genozip
(可在Conda , Docker Hub和) Genozip是一种用于基因组文件的压缩器-虽然它可以压缩任何文件(即不仅是基因组文件),但它经过优化可以压缩FASTQ,SAM / BAM / CRAM,VCF / BCF,FASTA,GVF,Phylip和23andMe文件。 如果它们已经使用.gz .bz2 .xz进行压缩,它甚至可以对其进行压缩(有关受支持的文件类型的完整列表,请参见'genozip --help = input')。 压缩率取决于要压缩的数据,通常,压缩.bam时,压缩率约为1.5-3倍; .fastq.gz文件(即压缩已压缩的文件),压缩率通常为2X-5X;压缩时,压缩率最高可达200倍。一个只有GT数据的未压缩的高样本数.vcf文件。 注册以接收与Genozip相关的低频更新: ://tinyurl.com/genozip 压缩是无损的-
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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