文件名称:
ab12phylo：AB12PHYLO：易于使用的集成应用程序，用于ML系统发育树推断-源码
开发工具:
文件大小: 10mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-15
详细说明：AB12PHYLO
是一个集成的，易于使用的管道，用于根据ABI测序数据推断最大似然（ML）系统树。 AB12PHYLO的核心是运行并行实例（Kozlov等，2019），并在参考数据库中进行BLAST搜索。 它基于系统发生的位置和序列相似性，实现直观，轻松的样品识别，并借助Tajima D等指标对种群子集进行选择，以评估正在进行的进化。
开发AB12PHYLO来鉴定植物病原体种群，可能是通过与茄属的平衡选择，尤其是在链格孢菌（Alternaria）中。 尽管全基因组测序的兴起，尽管多基因系统发育仍是一种广泛使用的方法，将来可能会在真菌性植物病原体或宿主植物上应用。
安装
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