文件名称:
htseq2multx:包装到fastq-multx使其具有模仿条形码的拆分器,从而轻松地与Princeton的HTSEQ Web界面集成-源码
开发工具:
文件大小: 73kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-14
详细说明:htseq2multx
包装到使其具有,从而轻松地与Princeton的 Web界面集成。
描述
Princeton 软件可访问的产生的数据。 它提供了用于上游分析和数据下载/传输的功能。
支持的功能的是对合并的测序样本进行多路分解。 此功能的最初实现使用内部Python工具,该工具以解释性脚本语言Python编写,称为 。 条码分割器的性能似乎受I / O约束,因此随着样本容量的增加和成本的下降,事实证明它不能很好地扩展。
是用C编写的多路分解工具,其运行速度比快几个数量级。 由于与高度集成,创建包装以使外观和行为类似比更改以使用。
安装
此存储库包含安装htseq2multx的模块依赖项和脚本以运行并转换其输出所必需的详细信息。 它不安装 。 请参阅该存储以获取其安装说明。
全系统安装
git clone https://github.com/hepcat72/htseq2mul
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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