文件名称:
autoLM：使用空间自校正的快速基因-环境关联测试-源码
开发工具:
文件大小: 6kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-14
详细说明：自动LM
使用空间自校正的基因-环境关联测试
概括
autoLM确定等位基因频率与环境指标之间的相关性。 它将使用简单的线性回归来确定最强的GEA相关性。 如果包括遗传簇和种群坐标，autoLM将使用空间自相关和种群结构作为随机变量来预测GEA。
输入
有两个主要输入文件和一个可选文件（请参阅示例文件）：
每个人群的等位基因频率，不包含标签格式：第一列是人群名称，其后是每个SNP的等位基因频率。
每个人口的环境变量的度量格式：行对应于人口，其顺序与文件1相同。不包括人口名称。 以下各栏是针对每个人口的原始环境措施。
人口坐标，以米为单位（可选），已缩小标签格式：第一列是人口名称，第二列
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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