文件名称:
DyakCladeGenomes:用于处理和分析果蝇雅库巴进化枝(D. santomea,D。teissieri和D. yakuba)的PacBio基因组(以及映射到这些参考的popgen样本)的脚本。-源码
开发工具:
文件大小: 4mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-14
详细说明:DyakClade基因组
这个软件库包含了所有的脚本(在tools子目录),并用于基于D. santomea,D. teissieri和果蝇D. yakuba的PacBio基因果蝇yakuba进化分析约束数据(尺寸允许时)。
依赖性普遍存在于所有细分市场中:
在许多此类管道中都隐式使用,尤其是fasta_formatter工具。
Awk(首选GNU awk,未经POSIX awk测试)
Perl(使用5.26.2,通常应与5.12+兼容)
GNU CoreUtils(主要是sort ,还有一些其他的)
GNU Make(使用4.2.1)
PacBio基因组:
我们生成了4个参考质量的基因组组装:
D. santomea STO CAGO 1482(近交14代后的PacBio数据)
D. teissieri GT53w(近交14代后的PacBio数据)
D. yakuba
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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