文件名称:
cbgb：彩色de Bruijn图形生成器-源码
开发工具:
文件大小: 126kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-14
详细说明：cbgb
彩色de Bruijn图形生成器（以及其他更新图形边缘的方法）
这是在小型基因组de Bruin图装配体上试验图算法的参考实现。 无意支持简洁的数据结构。
from cbgb . omfug import lnec
from cbgb import CdB , kmerise
seq = "pointy bird \ o pointy-pointy \ anoint my eyes \ anointy-nointy"
def join_walk ( walk ):
return '' . join ( map ( lambda c : c [ - 1 :], walk ))
for k in range ( 4 , 10 ):
g = CdB ( kmerise ( seq , k = k )
start = seq [: k - 1 ]
w
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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