文件名称:
customSeqDB:用于帮助从开源数据库创建特定于分类群的RDNA序列数据库的函数-源码
开发工具:
文件大小: 59kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-14
详细说明:customSeqDB
customSeqDB的目标是帮助从开源数据库(如NCBI和ENA)中创建自定义序列数据库。 函数允许在其API上搜索和获取记录,并解析这些记录以获取相关信息。 它还可以创建分类法SQLite文件,以允许获取用于创建自定义数据库的记录的分类法信息。
安装
开发版本可以通过以下方式从安装:
# install.packages("devtools")
devtools :: install_github( " salix-d/customSeqDB " )
例子
从NCBI获取序列详细信息
这将获得NCBI核苷酸数据库中与这些分类单元和基因匹配的所有记录的摘要,这些分
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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