文件名称:
TooT-M：检测膜蛋白的综合方法-源码
开发工具:
文件大小: 275mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-13
详细说明：TooT-M
该工具预测转运蛋白。
输入：Fasta格式的蛋白质序列输出：预测位置，1 =膜，0 =非膜
训练数据集可以在找到
资料夹
有许多文件夹支持TooT-M及其输出的运行。
中间文件
包含提取特征所需的同源性详细信息。 此处找到每个序列的psiBlast hits详细信息。
MSA_TPAAC / MSA_TPAAC ：包含测试集的已提取MSA_TPAAC功能
D b
包含执行BLAST时要使用的数据库。
src
使用该工具所需的脚本。
如何使用
此工具要求预先安装BLAST
用法： Rscript src/TooT_M.R -query= [-TooTM=] [-out=] [-db=][-topcons2=]
是Fasta格式的序列
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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