文件名称:
CRIS.py：分析NGS数据的CRISPR（或任何工程核酸内切酶）活性，并筛选克隆。 同时查看NHEJ或多个HDR事件-源码
开发工具:
文件大小: 29mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-13
详细说明：危机
分析CRISPR（或任何工程核酸内切酶）活性的NGS数据并筛选克隆。 同时查看NHEJ或多个HDR事件。
CRIS.py是一个易于使用的python脚本，可以分析NGS数据以获取用户定义的序列。 用户直接修改python脚本，然后在包含目标fastq文件的目录中运行该脚本。 运行CRIS.py之后，将在当前目录中创建一个包含分析的文件夹。
安装及要求
CRIS.py需要Python 2.7和Pandas库。 （请参阅-py3文件以使用Python 3运行脚本）安装Python 2.7和Pandas的一种简单方法是：通过以下途径获得Canopy： ：//store.enthought.com/downloads/或Anaconda，为
用法
要使用CRIS.py，请在Python编辑器中直接修改文件CRIS.py。 在引号（'）之间更改文本以反映您的目标扩增子。 CRIS.py以简
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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