文件名称:
cg_bond_calculator：计算从原子到CG映射轨迹的键相互作用-源码
开发工具:
文件大小: 5kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-13
详细说明：cg_bond_calculator
从原子到CG的映射轨迹计算键合相互作用
import mdtraj as md
import unyt as u
from cg_bond_calculator . bond_calculator import BondCalculator
traj = md . load ( "trajectory.dcd" , top = "topology.hoomdxml" )
calc = BondCalculator ( traj , T = 305 )
# Bond and angle parameters will be stored here:
calc . bond_params
calc . angle_params
# Alternatively, save the parameters to a .csv file:
calc . save
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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