开发工具:
文件大小: 2kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-13
详细说明:ALE重测序QC和突变发现管线
警告:仅在原始读取文件的副本上运行这些脚本。 保留所有原始读取文件的备份。
系统要求任何计算机:至少100GB存储空间。
背景
突变流水线完成了Pabinger等人(美国) 等2014年。“下一代基因组测序数据变异分析工具的调查。” 生物信息学简报15(2):256–78。
工作流程
准备数据
生成新的元数据: :
确保元数据中的所有文件名与您读取的文件和参考文件完全匹配。
将所有读取的文件,参考文件和元数据文件放在同一文件夹/目录中。保存此目录的绝对路径,以后需要它。
设置Docker
为Docker Hub创建一个帐户。 你可以在做
按照上的说明
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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