文件名称:
生物信息学工具：用于生物信息学和基因组学研究的有用算法和脚本的集合-源码
开发工具:
文件大小: 27kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-02-13
详细说明：生物信息学工具
为生物信息学和遗传学研究编写的有用算法和脚本的集合。
要求
Python 3.7以上
目录
结盟
为核苷酸和氨基酸序列找到最佳局部或全局比对的程序。
global_align.py
比对两个核苷酸序列的Needleman-Wunsch算法。
用法
global_align.py [fasta] -m [match] -s [mis] -d [indel]
必填参数
fasta：包含用于比对的序列数据的文件，用“>”表示
-m / --match：每次比赛的比对得分
-s / --mismatch：每次不匹配的罚款
-d / --indel：每次插入或删除的惩罚
可选参数
-a：输出对齐
global_align_aa.py
比对两个氨基酸序列的Needleman-Wunsch算法。 使用BLOSUM62评分矩阵评分。
用法
global_align_aa.py [
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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